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Uwe Kraeft

Genomische Abbildungen – Grundlagen der n-Tupelmethode

ISBN:978-3-8440-5156-8
Reihe:Medizinischen Informatik und Bioinformatik
Schlagwörter:Mathematik; Bioinformatik; n-Tupelmethode; Tripelverfahren; Quadrupelverfahren; Hominiden; Bivalvia; Spiralen
Publikationsart:Fachbuch
Sprache:Deutsch
Seiten:128 Seiten
Abbildungen:9 Abbildungen
Gewicht:182 g
Format:21 x 14,8 cm
Bindung:Paperback
Preis:18,50 € / 23,20 SFr
Erscheinungsdatum:April 2017
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ZusammenfassungAusgangspunkt des vorliegenden Textes war unter anderem die Beschäftigung mit der Bioinformatik und den Sequenzen des mitochondrialen Genoms in den Bänden 2 bis 4 der "Bivalvia-Bivalves-Muscheln" von Uwe Kraeft & Michael Kraeft, aus denen Teile entnommen wurden und in denen zahlreiche Anwendungsbeispiele zu finden sind. Organismen sind bekanntlich Abbildungen des Genoms. In vergleichbarer Weise sind die hier gebildeten Tripel- oder Quadrupelhäufigkeiten ein Bild des Genoms und damit vergleichbar mit den Organismen. Dabei ist zumindest anzunehmen, dass identische oder ähnliche Sequenzen gleiche oder vergleichbare n-Tupelhäufigkeiten zeigen.

Hier werden in 6 Kapiteln die Abbildungen von diskreten Elementen, die Rekonstruktion als Abbildung, die Abbildung von alphanumerischen Sequenzen durch sich überlappende n-Tupel, intermittierendes Scannen und Zusammenfügung von sich überlappenden n-Tupeln, die mitochondrialen Gene der Hominiden sowie der Bivalvia in elementarer Weise dargestellt. Eine Literaturauswahl und nahezu alle Programme sind beigefügt. In einem Anhang werden die Spiralen kurz behandelt.
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