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Rezensionsexemplar
Andreas Hentschel
Proteomische Analyse funktioneller Prozesse und metabolischer Stoffwechselwege während der Adipogenese durch Etablierung von SRM-Methoden
Ziel dieser Arbeit war die proteomische Analyse funktioneller Prozesse sowie metabolischer Stoffwechselwege primärer Stammzellen während der Adipogenese.
Für die experimentelle Durchführung wurden Proben von unterschiedlichen Zeitpunkten der Adipogenese mittels einer subzellulären Fraktionierung in verschiedene Kompartimente aufgetrennt. Im Anschluss erfolgte die Auftrennung der Proben mit Hilfe der nanoscale Umkehrphasenchromatographie, gekoppelt mit einer massenspektrometrischen Analyse (nano LC-MS/MS).
Insgesamt konnten im globalen Ansatz über 6300 Proteine identifiziert werden, wobei 7 Stoffwechselwege, beteiligt am Energie- und Fettsäuremetabolismus, sowie 2 für die Adipogenese wichtige Signaltransduktionswege durch den markierungsfreien und SRM-Ansatz untersucht wurden. Die Ergebnisse zeigen deutlich die dynamische Regulation ganzer Stoffwechselwege sowie einzelner Proteine im zeitlichen Verlauf der Adipogenese.
Für die experimentelle Durchführung wurden Proben von unterschiedlichen Zeitpunkten der Adipogenese mittels einer subzellulären Fraktionierung in verschiedene Kompartimente aufgetrennt. Im Anschluss erfolgte die Auftrennung der Proben mit Hilfe der nanoscale Umkehrphasenchromatographie, gekoppelt mit einer massenspektrometrischen Analyse (nano LC-MS/MS).
Insgesamt konnten im globalen Ansatz über 6300 Proteine identifiziert werden, wobei 7 Stoffwechselwege, beteiligt am Energie- und Fettsäuremetabolismus, sowie 2 für die Adipogenese wichtige Signaltransduktionswege durch den markierungsfreien und SRM-Ansatz untersucht wurden. Die Ergebnisse zeigen deutlich die dynamische Regulation ganzer Stoffwechselwege sowie einzelner Proteine im zeitlichen Verlauf der Adipogenese.
Schlagwörter: Adipogenesis; mass spectrometry; SRM; method development; metabolic pathways
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